近日，我所在国际知名数据期刊《Scientific Data》（JCR Q1，IF:7.2）发表题为“Establishment of comparative transcriptome dataset related to nitrogen use efficiency in melon”的研究论文，成功构建甜瓜氮利用效率比较转录组数据集，为甜瓜氮高效分子育种提供宝贵的数据资源与基因储备。

甜瓜是世界范围内重要的园艺经济作物，在我国设施瓜果产业中占有重要地位。生产中普遍存在氮肥过量施用问题，不仅推高生产成本，还造成肥料浪费、病虫害加重、水土环境污染等一系列问题。提升甜瓜氮利用效率，培育氮高效甜瓜品种，是实现甜瓜产业绿色可持续发展的重要途径。不同甜瓜种质对氮素吸收、利用能力存在显著基因型差异，但目前甜瓜氮利用效率差异背后的分子遗传基础尚不清晰，制约甜瓜氮高效育种工作推进。

该研究从118份甜瓜自交系中筛选获得2份氮高效（T514、T55）、2份氮低效（T213、T23）代表性自交系材料，设置高氮、低氮两种氮素处理，于果实膨大期采集坐果节位功能叶片，完成24份样品Illumina RNA seq测序，获得160.31 Gb高质量转录组数据，基因组比对率大于94%，共注释26222个表达基因，包含644个新预测基因。通过相关性分析、主成分分析证实样本重复性好，不同种质、不同氮处理转录组特征区分明显。通过多组差异基因联合比对，筛选得到824个与甜瓜氮利用效率紧密关联的核心差异表达基因，涉及谷胱甘肽代谢、氮代谢、氨基酸生物合成等关键通路，同时挖掘得到MYB、NAC、WRKY、bHLH等大量氮响应转录因子。选取6个代表性基因开展RT qPCR验证，基因表达模式与转录组测序结果高度吻合，证明数据集可靠准确。该数据集不仅为解析甜瓜氮素响应分子机制提供基础材料，也为甜瓜分子育种、筛选氮高效候选基因、培育减氮稳产新品种提供重要支撑，对推动甜瓜绿色生产、化肥减量增效具有实际应用价值。

图1 不同氮利用效率甜瓜核心差异表达基因（DEGs）的鉴定与功能分析

我所赵永博士为论文第一作者，康利允副研究员为共同第一作者，赵卫星研究员为通讯作者。该研究得到国家西甜瓜产业技术体系（CARS 25）、河南省西瓜甜瓜产业技术体系（HARS 22 10G1）、河南省科技攻关计划（252102110307）、河南省农业良种攻关专项（2022010503）等项目资助。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41597-026-07714-1